窒息可導致體內氧氣水平下降和二氧化碳水平上升，結果腦部被促使恢復呼吸，造成覺醒。每次覺醒腦部會向上呼吸道傳達指令，使上呼吸道打開，恢復呼吸。患者覺醒時通常會發出很大的鼻息聲或喘氣聲。頻密的覺醒會令患者睡眠不足，結果患者日間精神不振，日常工作大受影響。

患者後遺症可大可小，輕則對日常生活構成困擾，重則危害生命。以下乃睡眠窒息症的影響：